تضم العمادة قسم الديوان، وقسم الدراسات العليا، وقسم البحث العلمي، وقسم النشر، وقسم نقل التكنولوجيا.
يقوم قسم الدراسات العليا بتنظيم عملية قبول الطلبة ومتابعة شؤونهم في برامج الماجستير والدكتوراه والدبلوم العالي، سواء في البرامج العادية أو الدولية. بالإضافة إلى ذلك، يتولى القسم دراسة طلبات استحداث البرامج الجديدة وتعديل الخطط الدراسية ورفعها إلى المجالس المختصة، بهدف ضمان تقديم برامج دراسية متميزة تواكب المتطلبات الأكاديمية والعلمية واحتياجات سوق العمل المحلي والإقليمي والعالمي.
يتولى قسم البحث العلمي تنظيم شؤون البحث العلمي في الجامعة، من خلال تقديم الدعم اللازم للمشاريع البحثية، وتوفير حوافز للنشر العلمي، وتقديم جوائز للبحث العلمي المتميز، بالإضافة إلى تنظيم الزيارات البحثية الصيفية. كما يضم القسم مجلس أخلاقيات البحث العلمي على الإنسان المعتمد من المؤسسة العامة للغذاء والدواء، ومجلس أخلاقيات البحث العلمي على الحيوان، وذلك لضمان التزام الباحثين بأعلى معايير الأخلاق في أبحاثهم.
يهتم قسم النشر بإصدار المجلات الأردنية العلمية المتخصصة الصادرة عن العمادة والمدعومة من صندوق دعم البحث العلمي والابتكار. كما يشرف القسم على عملية تحكيم الأبحاث لضمان جودتها قبل نشرها، ويعمل على نشر الكتب المحكمة ضمن منشورات العمادة، مما يساهم في تعزيز السمعة الأكاديمية للجامعة ونشر المعرفة العلمية على نطاق واسع.
يسعى قسم نقل التكنولوجيا إلى تنظيم حقوق الملكية الفكرية في الجامعة وتحديث التشريعات بما يتناسب مع التوجهات العالمية في هذا الشأن. كما يوجه الباحثين نحو تحويل أبحاثهم إلى براءات اختراع لحفظ حقوقهم الفكرية، ويبحث عن فرص لتأجير هذه البراءات واستثمارها. بالإضافة إلى ذلك، يدرس القسم فرص إنشاء شركات ناشئة قائمة على مخرجات البحث العلمي، مما يعزز من دور الجامعة في الابتكار والتطوير الاقتصادي.